Bonjour,
J'ai compris ceci après avoir posé une question similaire à mon centre de gestion (je suis en EI) : soit votre compta est informatisée et dans ce cas il faut effectivement un logiciel qui gère toute votre compta avec les normes des FEC (donc oubliez Excel), soit votre compta est manuelle (ce qui m'étonnerait si vous passez par un expert-comptable), et attention dans ce cas ça veut vraiment dire "à la main" (par exemple en EI livre journal Exacompta 9620 rempli à la main) et les factures peuvent aussi se faire sans logiciel dédié, à condition bien sûr de respecter les règles de toute facturation (numérotation, chronologie, etc.)