Gestion des notes de frais EURL

Bonjour,
mon époux a créé son EURL et je l'aide en tant que conjoint collaborateur pour toute la partie administrative.
J'ai plusieurs questions mais une par jour me suffira pour avancer lentement mais sûrement. 🙄
Oui, j'ai beau être de formation RH et avoir enseigné cette matière durant des années, sur le terrain, en commençant de rien, c'est casse-tête... ms passionnant aussi.

Alors: mon mari a des notes de frais quotidiennes et ponctuelles (repas, transport, matériel...).
Je les note et les répertorie dans un fichier XL.
En fin de mois, nous les déduisons de sa rémunération pour nous les rembourser directement.
Je précise qu'il est à l'IS.
Quelles sont les démarches ensuite?
Quelles déclarations à faire pour ces notes de frais?
Comment les prendre en compte dans l'impôt sur le revenu?
Comment se faire reverser la TVA sur ces frais (bien sûr pas sur les repas, trop de complications pr rien)?
Merci pour vos lumières.