CDI et entreprise individuelle

Bonjour,

Je suis en EI depuis plusieurs années. Suite à une évolution de mes compétences, en résumé développement d'applications iOS, j'ai recentré mes recherches de missions dans ce domaine. J'ai eu plusieurs contact avec des entreprises qui refusent d'employer un freelance et me proposent un CDI. Ce que je ne souhaite pas.

Mon comptable m'a confirmé que les 2 pouvaient cohabiter et qu'il fallait jouer la clarté avec l'entreprise en le faisant mentionner dans le contrat de travail. Mais qu'en est-il des clauses de non-concurrence et de loyauté ?

Précisions
Par mon EI j'ai des applications en vente sur l'AppStore d'Apple. Si je viens à être embauché en CDI par une SSII alors il est possible que certaines applications sur lesquelles je vais être amené à travailler rentre en concurrence avec mes propres applications.

Merci